پویش ژنومی نشانه های انتخاب در گاومیش های خوزستانی و مازندرانی
Authors
abstract
شناسایی مناطق ژنومی که هدف انتخاب بوده اند، از بحث برانگیزترین مباحث در حوزة تحقیقات ژنتیک حیوانی، به خصوص در حیوانات اهلی است. در این مطالعه، پویش کل ژنوم برای شناسایی مناطقی از ژنوم که در گاومیش های خوزستانی و مازندرانی هدف انتخاب های طبیعی یا مصنوعی قرار گرفته اند، اجرا شده است. بدین منظور 148 رأس گاومیش رودخانه ای شامل جمعیت های خوزستانی (121 رأس) و مازندرانی (27 رأس)، به وسیلة آرایه های ژنومیکی axiom® buffalo genotyping 90k تعیین ژنوتیپ شدند. جهت جستجوی نشانه های انتخاب از برآوردگر نااُریب fst (θ) استفاده شد. در مجموع 23 منطقه که نشانگرهای snp آن ها بالاتر از 1/0 درصد حد بالای توزیع تجربی fst بود، به عنوان نشانه های انتخاب شناسایی شده و مورد بررسی های بیشتر قرار گرفتند. بعد از انطباق مناطق ژنومی انتخاب شده با مناطق ژنومی متناظر آن روی ژنوم گاو (umd3.1 bos taurus genome)، 64 ژن و 27 qtl شناسایی شد. تعدادی از این ژن ها در مطالعات قبلی نیز به عنوان نشانه های انتخاب گزارش شده اند. برخی از این ژن ها احتمالاً در مسیرهای بیولوژیکی که با اهلی شدن حیوانات (توسعة مغز و عملکردهای رفتاری، پیگماسیون و آداپته شدن به محیط زندگی و شرایط جغرافیایی) و تولید شیر مرتبط می باشند، درگیرند. بررسی ها همچنین نشان داد که qtlهای شناسایی شده در این تحقیق با صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با راندمان تبدیل غذایی، وزن بدن، چربی زیرپوستی، افزایش وزن روزانه، تیپ، تردی گوشت، ترکیبات شیر، اتصالات پستانی، اندازة گوساله و گوساله زایی آسان ارتباط دارند. به هرحال جهت شناسایی نقش دقیق این ژن ها و qtlها لازم است مطالعات پیوستگی و عملکردی بیشتری انجام گیرد.
similar resources
پویش ژنومی نشانه‌های انتخاب در گاومیشهای خوزستانی و مازندرانی
شناسایی مناطق ژنومی که هدف انتخاب بوده‌اند، از بحث‌برانگیزترین مباحث در حوزة تحقیقات ژنتیک حیوانی، به‌خصوص در حیوانات اهلی است. در این مطالعه، پویش کل ژنوم برای شناسایی مناطقی از ژنوم که در گاومیشهای خوزستانی و مازندرانی هدف انتخاب‌های طبیعی یا مصنوعی قرار گرفته‌اند، اجرا شده است. بدین منظور 148 رأس گاومیش رودخانه‌ای شامل جمعیت‌های خوزستانی (121 رأس) و مازندرانی (27 رأس)، به وسیلة آرایه‌های ژن...
full textبررسی ژنومی ساختار جمعیتی و ارتباط فیلوژنتیکی گاومیش نژاد خوزستانی
زمینه مطالعاتی: باتوجه به اهمیت گاومیش در جهت سازگاری با محیطهای خشک، مقاومت در برابر بیماریها، پایین بودن هزینههای نگهداری و استفاده موثر از مواد خشبی کم ارزش در جهت تولید مواد پروتئینی با ارزش، ارتقا ژنتیکی آن حائز اهمیت فراوانی است. هدف: این تحقیق به منظور یافتن فواصل ژنتیکی گاومیشهای مناطق مختلف خوزستان و ارتباط ژنتیکی آنها به کمک آرایه چندشکلی تک نوکلئوتیدی اجرا شد. روش کار: در این م...
full textکاوش ژنومی نشانه های انتخاب در گاوهای بومی نژاد سرابی و تالشی ایران
The aim of this study was to find the footprint of selection in native Sarabi and Taleshi cattle breeds 296 cattle from two breeds were sampled and genotyped. by 40 k microarray of illumine company. 43 animals were removed because their ACR was below 0.09. Markers were filtered with minor allele frequency (MAF) equal 0.01 and Hardy-Weinberg equilibrium test (10-6). After filtering, 28782 marker...
full textمقایسه روش های مختلف آماری در انتخاب ژنومی گاوهای هلشتاین
Genomic selection combines statistical methods with genomic data to predict genetic values for complex traits. The accuracy of prediction of genetic values in selected population has a great effect on the success of this selection method. Accuracy of genomic prediction is highly dependent on the statistical model used to estimate marker effects in reference population. Various factors such a...
full textانتخاب ژنومی
در دهه های اخیر همزمان با پیشرفت ژنتیک ملکولی تحقیقات زیادی برای شناسایی ژنها و یا قطعات کروموزومی موثر بر صفات مهم اقتصادی در حیوانات اهلی انجام شده است. علیرغم پژوهش های متعددی که در ارتباط با انتخاب به کمک نشانگر (mas) انجام شد، به دلیل محدودیت های این روش کاربرد های آن محدود و افزایش پیشرفت ژنتیکی کم بوده است. با تکمیل موفقیت آمیز توالی یابی ژنوم انسان و پیشرفت های عظیم در تکنولوژی ژنوتیپ ک...
full textMy Resources
Save resource for easier access later
Journal title:
علوم دامی ایرانPublisher: پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
ISSN 2008-4773
volume 46
issue 2 2015
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023